Os Cursos Livres e Clínicas são os cursos não continuados, oferecidos semestralmente, com duração máxima de quatro meses, podendo ser apresentados em até dois módulos consecutivos anualmente, e que não estão vinculados aos Cursos de Formação.
Os Cursos Livres são oferecidos por profissionais que submetem seus projetos de cursos para a avaliação da Direção Pedagógica da Tom Jobim – Escola de Música do Estado de São Paulo. A proposição dos Cursos Livres em fluxo contínuo permite que eles sejam oferecidos a qualquer momento do ano, conforme disponibilidades de recursos, espaço e demanda.